M. Uebayasi: шукати на сайті Z-Library

Найбільша колекція наукових статей у сіті. 70,000,000+ безкоштовних статей.

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024

Z-Library - одна з найбільших онлайн-бібліотек у світі, в якій зберігається більше 17,000,000 книг та 84,837,000 статей. Ми намагаємось зробити літературу доступною кожному. Сьогодні (15 вересня 2024) ми відкриваємо додатковий збір пожертвувань на підтримку та розвиток проекту.

Також БЕЗЛІМТНІ завантаження (протягом 31 дня після завершення пожертвування) доступні для ВСІХ користувачів, які підтримають проект в період збору коштів до 1 жовтня 2024.

Про збір коштів Детальніше

Підтримати

Книги
Статті (45)
Найпопулярніші
Перелік
- Перелік
- Таблиця

Fragment molecular orbital method: use of approximate electrostatic potential

Tatsuya Nakano, Tsuguchika Kaminuma, Toshiyuki Sato, Kaori Fukuzawa, Yutaka Akiyama, Masami Uebayasi, Kazuo Kitaura

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 179 KB

english, 2002

Fragment molecular orbital method: an approximate computational method for large molecules

Kazuo Kitaura, Eiji Ikeo, Toshio Asada, Tatsuya Nakano, Masami Uebayasi

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 197 KB

english, 1999

Fast and accurate molecular dynamics simulation of a protein using a special-purpose computer

Komeiji, Yuto, Uebayasi, Masami, Takata, Ryo, Shimizu, Akihiro, Itsukashi, Keiji, Taiji, Makoto

Журнал:

Journal of Computational Chemistry

Рік:

1997

Мова:

english

Файл:

PDF, 428 KB

english, 1997

Computational design of a substrate specificity mutant of a protein

Honda, Nobuo, Komeiji, Yuto, Uebayasi, Masami, Yamato, Ichiro

Журнал:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Рік:

1996

Мова:

english

Файл:

PDF, 548 KB

english, 1996

Ab initio quantum mechanical study of the binding energies of human estrogen receptor α with its ligands: An application of fragment molecular orbital method

Kaori Fukuzawa, Kazuo Kitaura, Masami Uebayasi, Kotoko Nakata, Tsuguchika Kaminuma, Tatsuya Nakano

Журнал:

Journal of Computational Chemistry

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 623 KB

english, 2005

Ab initio fragment molecular orbital (FMO) method applied to analysis of the ligand–protein interaction in a pheromone-binding protein

Tadashi Nemoto, Dmitri G. Fedorov, Masami Uebayasi, Kenji Kanazawa, Kazuo Kitaura, Yuto Komeiji

Журнал:

Computational Biology and Chemistry

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 343 KB

english, 2005

Fragment molecular orbital method: application to polypeptides

Tatsuya Nakano, Tsuguchika Kaminuma, Toshiyuki Sato, Yutaka Akiyama, Masami Uebayasi, Kazuo Kitaura

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 113 KB

english, 2000

Fragment molecular orbital method: application to molecular dynamics simulation, ‘ab initio FMO-MD’

Yuto Komeiji, Tatsuya Nakano, Kaori Fukuzawa, Yutaka Ueno, Yuichi Inadomi, Tadashi Nemoto, Masami Uebayasi, Dmitri G. Fedorov, Kazuo Kitaura

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 206 KB

english, 2003

Pair interaction molecular orbital method: an approximate computational method for molecular interactions

Kazuo Kitaura, Takuya Sawai, Toshio Asada, Tatsuya Nakano, Masami Uebayasi

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 143 KB

english, 1999

Molecular dynamics simulation of trp-repressor/operator complex: analysis of hydrogen bond patterns of protein–DNA interaction

A. Suenaga, C. Yatsu, Y. Komeiji, M. Uebayasi, T. Meguro, I. Yamato

Журнал:

Journal of Molecular Structure

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 364 KB

english, 2000

A molecular dynamics study of solvent behavior around a protein

Yuto Komeiji, Masami Uebayasi, Jun-ichiro Someya, Ichiro Yamato

Журнал:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Рік:

1993

Мова:

english

Файл:

PDF, 688 KB

english, 1993

Molecular dynamics simulations of trp apo-and holorepressors: Domain structure and ligand–protein interaction

Yuto Komeiji, Masami Uebayasi, Ichiro Yamato

Журнал:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Рік:

1994

Мова:

english

Файл:

PDF, 874 KB

english, 1994

A clinicopathologic study of mucinous adenocarcinoma of the stomach

Hideki Kawamura, Yukifumi Kondo, Shohei Osawa, Yasunori Nisida, Kuniaki Okada, Hiroyuki Isizu, Takasi Uebayasi, Manabu Takahasi, Tunetake Hata

Журнал:

Gastric Cancer

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 123 KB

english, 2001

Fragment molecular orbital method: analytical energy gradients

Kazuo Kitaura, Sin-Ichirou Sugiki, Tatsuya Nakano, Yuto Komeiji, Masami Uebayasi

Журнал:

Chemical Physics Letters

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 122 KB

english, 2001

Computational Observation of an Ion Permeation Through a Channel Protein

Atushi Suenaga, Yuto Komeiji, Masami Uebayasi, Toshiyuki Meguro, Minoru Saito, Ichiro Yamato

Журнал:

Bioscience Reports

Рік:

1998

Мова:

english

Файл:

PDF, 930 KB

english, 1998

Purification and properties of 4-hydroxycyclohexanecarboxylate dehydrogenase from Corynebacterium cyclohexanicum

Hitoshi OBATA, Masami UEBAYASI, Toshi KANEDA

Журнал:

FEBS Journal

Рік:

1988

Мова:

english

Файл:

PDF, 824 KB

english, 1988

Enantiotopic differentiation in horse-liver alcohol-dehydrogenase-catalyzed oxidoreduction studied with novel substrates having organometallic moieties

Yoshimitsu YAMAZAKI, Masami UEBAYASI, Kuniaki HOSONO

Журнал:

FEBS Journal

Рік:

1989

Мова:

english

Файл:

PDF, 448 KB

english, 1989

Enantiotopic differentiation in horse-liver alcohol-dehydrogenase-catalyzed oxidoreduction studied with novel substrates having organometallic moieties

Yoshimitsu YAMAZAKI, Masami UEBAYASI, Kuniaki HOSONO

Журнал:

FEBS Journal

Рік:

1989

Мова:

english

Файл:

PDF, 993 KB

english, 1989

RNA hydrolysis via an oxyphosphorane intermediate

Tadafumi Uchimaru, Joey W. Storer, Kazutoshi Tanabe, Masami Uebayasi, Satoshi Nishikawa, Kazunari Taira

Журнал:

Biochemical and Biophysical Research Communications

Рік:

1992

Мова:

english

Файл:

PDF, 422 KB

english, 1992

Induction of adiponectin by natural and synthetic phenolamides in mouse and human preadipocytes and its enhancement by docosahexaenoic acid

Yoshimitsu Yamazaki, Yasuhiro Kawano, Masami Uebayasi

Журнал:

Life Sciences

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.14 MB

english, 2008

Molecular dynamics simulations revealed Ca2+-dependent conformational change of Calmodulin

Yuto Komeiji, Yutaka Ueno, Masami Uebayasi

Журнал:

FEBS Letters

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 434 KB

english, 2002

Corrigendum to: Molecular dynamics simulations revealed Ca2+-dependent conformational change of Calmodulin (FEBS 26172): [FEBS Letters 521 (2002) 133–139]

Yuto Komeiji, Yutaka Ueno, Masami Uebayasi

Журнал:

FEBS Letters

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 43 KB

english, 2002

Change in Conformation by DNA-Peptide Association: Molecular Dynamics of the Hin-Recombinase–hixL Complex

Komeiji, Yuto, Uebayasi, Masami

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 684 KB

english, 1999

Energetics of RNA cleavage: implications for the mechanism of action of ribozymes

Taira, Kazunari, Uebayasi, Masami, Maeda, Hidekatsu, Furukawa, Kensuke

Журнал:

Protein Engineering Design and Selection

Рік:

1990

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.76 MB

english, 1990

The Fragment Molecular Orbital Method for Geometry Optimizations of Polypeptides and Proteins

Fedorov, Dmitri G., Ishida, Toyokazu, Uebayasi, Masami, Kitaura, Kazuo

Журнал:

Journal of Physical Chemistry A

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 711 KB

english, 2007

Existence of a marginally stable intermediate during the base-catalyzed methanolysis of methylene phosphate and ab initio studies of the monohydration of the pentacoordinated oxyphosphorane intermediate

Storer, Joey W., Uchimaru, Tadafumi, Tanabe, Kazutoshi, Uebayasi, Masami, Nishikawa, Satoshi, Taira, Kazunari

Журнал:

Journal of the American Chemical Society

Рік:

1991

Мова:

english

Файл:

PDF, 896 KB

english, 1991

Properties of dianionic oxyphosphorane intermediates: implication to the reaction profile for base-catalyzed RNA hydrolysis

Taira, Kazunari, Uchimaru, Tadafumi, Storer, Joey W., Yliniemela, Ari, Uebayasi, Masami, Tanabe, Kazutoshi

Журнал:

Journal of Organic Chemistry

Рік:

1993

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.35 MB

english, 1993

Theoretical and Experimental Considerations on the Hammerhead Ribozyme Reactions: Divalent Magnesium Ion Mediated Cleavage of Phosphorus-Oxygen Bonds

Uebayasi, Masami, Uchimaru, Tadafumi, Sawata, Shinya, Shimayama, Takashi, Taira, Kazunari, Koguma, T.

Журнал:

Journal of Organic Chemistry

Рік:

1994

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.10 MB

english, 1994

Electrostatic Interactions That Determine the Rate of Pseudorotation Processes in Oxyphosphorane Intermediates: Implications with Respect to the Roles of Metal Ions in the Enzymatic Cleavage of RNA

Uchimaru, Tadafumi, Uebayasi, Masami, Hirose, Takuji, Tsuzuki, Seiji, Yliniemelä, Ari, Tanabe, Kazutoshi, Taira, Kazunari

Журнал:

Journal of Organic Chemistry

Рік:

1996

Мова:

english

Файл:

PDF, 265 KB

english, 1996

Molecular Dynamics Simulation of the Hin-Recombinase—DNA Complex

Komeiji, Yuto, Uebayasi, Masami

Журнал:

Molecular Simulation

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.19 MB

english, 1999

Free energy perturbation study on a Trp-binding mutant (Ser 88 →Cys) of the trp -repressor

Komeiji, Yuto, Uebayasi, Masami, Someya, Jun-ichiro, Yamato, Ichiro

Журнал:

Protein Engineering Design and Selection

Рік:

1992

Мова:

english

Файл:

PDF, 685 KB

english, 1992

Cyclic oxyphosphoranes as model intermediates during splicing and cleavage or RNA: Ab initio molecular orbital calculations on the conformational analysis

Taira, Kazunari, Uebayasi, Masami, Furukawa, Kensuke

Журнал:

Nucleic Acids Research

Рік:

1989

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.44 MB

english, 1989

Molecular dynamics simulation of trp -aporepressor in a solvent

Komeiji, Yuto, Uebayasi, Masami, Someya, Jun-ichiro, Yamato, Ichiro

Журнал:

Protein Engineering Design and Selection

Рік:

1991

Мова:

english

Файл:

PDF, 461 KB

english, 1991

Incorporation of [ 14 C]Methanol and [ 14 C]Bicarbonate by Hyphomicrobium sp. 53-49 under Various Growth Conditions: Aerobic, Denitrifying and Autotrophic

Uebayasi, Masami, Kawamura, Sugio, Tomizuka, Noboru, Kamibayashi, Akira, Tonomura, Kenzo

Журнал:

Agricultural and Biological Chemistry

Рік:

1984

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.13 MB

english, 1984

Determination of the Absolute Configuration of (−)-2,2,2-(Trifluoro-1-hydroxyethyl)ferrocene

Goto, Midori, Yamazaki, Yoshimitsu, Uebayasi, Masami

Журнал:

Bulletin of the Chemical Society of Japan

Рік:

1993

Файл:

PDF, 508 KB

1993

Prediction of Endocrine Disruptors Based on a New Structure-Activity Relationship for Sex and Environmental Hormones Using Chemical Hardness Concept.

KOBAYASHI, Shigeki, SUGAYA, Toshiya, SAKATA, Nobuo, UEBAYASI, Masami, SAMESHIMA, Keiichiro, TANAKA, Akira

Журнал:

CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 119 KB

english, 2001

Autotrophic growth of a Hyphomicrobium sp. and its hydrogenase activity.

UEBAYASI, Masami, TOMIZUKA, Noboru, KAMIBAYASHI, Akira, TONOMURA, Kenzo

Журнал:

Agricultural and Biological Chemistry

Рік:

1981

Мова:

english

Файл:

PDF, 423 KB

english, 1981

Analysis of binding mode of calcium ion to the unpaired EF-hand like motif in a P-type Ca^-ATPase, Pmr1, by using computer modeling

Ohfuku, Y, Shinoda, W, Uebayasi, M, Tanaka, H, Mikami, M, Tateno, M

Журнал:

Seibutsu Butsuri

Рік:

2001

Файл:

PDF, 271 KB

2001

1B0900 Development of a quantum simulation algorithm based on the fragment MO method

Komeiji, Y., Nakano, T., Fukuzawa, K., Nemoto, T., Ueno, Y., Kitaura, K., Uebayasi, M.

Журнал:

Seibutsu Butsuri

Рік:

2002

Файл:

PDF, 242 KB

2002

Lighting design of Fuji Television Network, Inc. Building

Ohwada, Yoshihisa, Tsuchiya, Chiaki, Masuo, Takashi, Hoshino, Kouji, Oka, Masahiro, Uebayasi, Kazumasa, Shiroishi, Munehiro, Ohno, Isao

Рік:

1997

Файл:

PDF, 2.29 MB

1997

Incorporation of (14C)methanol and (14C)bicarbonate by Hyphomicrobium sp. 53-49 under various growth conditions: Aerobic, denitrifying and autotrophic.

UEBAYASI, Masami, KAWAMURA, Sugio, TOMIZUKA, Noboru, KAMIBAYASHI, Akira, TONOMURA, Kenzo

Журнал:

Agricultural and Biological Chemistry

Рік:

1984

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.23 MB

english, 1984

Stereoselectivity of the enzymatic reduction of aldehydic and ketonic carbonyl groups in planar chiral organomanganese complexes.

YAMAZAKI, Yoshimitsu, UEBAYASI, Masami, SOMEYA, Jun-ichiro, HOSONO, Kuniaki

Журнал:

Agricultural and Biological Chemistry

Рік:

1990

Мова:

english

Файл:

PDF, 960 KB

english, 1990

Comparison of the key enzymes of Hyphomicrobium sp. 53-49 under various growth conditions: Aerobic, denitrifying and autotrophic.

UEBAYASI, Masami, KAWAMURA, Sugio, TOMIZUKA, Noboru, KAMIBAYASHI, Akira

Журнал:

Agricultural and Biological Chemistry

Рік:

1985

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.33 MB

english, 1985

Theoretical analyses on the role of Mg2+ ions in ribozyme reactions.

Uchimaru, T, Uebayasi, M, Tanabe, K, Taira, K

Журнал:

The FASEB Journal

Рік:

1993

Файл:

PDF, 1.24 MB

1993

3D Structure Based Atomic Charge Calculation for Molecular Mechanics and Molecular Dynamics Simulations

Nakano, Tatsuya, Kaminuma, Tsuguchika, Uebayasi, Masami, Nakata, Yoshiro

Журнал:

Chem-Bio Informatics Journal

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 35 KB

english, 2001